Mida NIPTIFY analüüsib?
NIPTIFY analüüsib kõiki 23 loote kromosoomipaari, kuid on kliiniliselt testitud viie levinud kromosoomhaiguse riski leidmiseks:
Downi sündroom(21. kromosoomi trisoomia)
DiGeorge sündroom (mikrodeletsioon 22q11)
Edwardsi sündroom (18. kromosoomi trisoomia)
Patau sündroom (13. kromosoomi trisoomia)
Turneri sündroom (X-kromosoomi monosoomia)
Lisaks analüüsib NIPTIFY test seitsme kliiniliselt olulise mikrodeletsiooni piirkonda ning võib neid kõrge riski korral juhuleiuna raporteerida:
Williams-Beuren sündroom (7q11)
1p36 deletsiooni sündroom
Angelman ja Prader-Willi sündroom (15q)
Wolf-Hirschhorni sündroom (4p)
Jacobseni sündroom (11q)
Cri-du-chat ehk kassikisa sündroomi (5p)
Langer-Giedioni sündroom (8q)
NIPTIFY analüüsib loote sugukromosoomide kõrvalekaldeid ning võib neid kõrge riski korral juhuleiuna raporteerida:
Klinefelteri sündroom (XXY)
Jacobsi sündroom (XYY)
Trisoomia X (XXX)
Muutused ülejäänud autosoomsetes kromosoomides, trisoomiad ja monosoomiad, raporteeritakse kui juhuleiud. Samuti võib NIPTIFY testis juhuleiuks olla 13. 18. või 21. kromosoomi osaline, suurem kui 30 miljonit DNA aluspaari, DNA koopiaarvu muutus.
Soovi korral saab teada loote soo.
NIPTIFY kvaliteet
Uuringu eeldused
Loote fraktsioon
Focus Plus tehnoloogia
NIPTIFY kvaliteet
NIPTIFY uuring on loote kromosoomhaiguste tuvastamisel oluliselt täpsem kui ultraheli ja OSCAR test. Tartu Ülikooli Kliinikumi Lastefondi eestvedamisel viidi läbi uuring, mille tulemusel aitas NIPTIFY test ära hoida 91% invasiivseid kromosoomuuringuid. NIPTIFY test on leidnud seni 100% tundlikkusega üles kromosoomhaiguse riskiga looted. Kõrge riskiga tulemuse korral suunatakse patsient edasistele uuringutele. Tänu oma usaldusväärsusele on NIPTIFY test teatud juhtudel haigekassa poolt hüvitatav. NIPTIFY test on kliiniliselt testitud ja tulemused avaldatud teadusajakirjades.
NIPTIFY Focus Plus testi tundlikkus on enam kui 99,9% trisoomiate 21, 18 ja 13, monosoomia X ja DiGeorge mikrodeletsiooni* (22q11) suhtes. Testi spetsiifilisus on enam kui 99,9% trisoomiate 21 ja 18 ning DiGeorge mikrodeletsiooni suhtes. Monosoomia X ja trisoomia 13 suhtes on testi spetsiifilisus 99,2%. NIPTIFY testi nõusolekuvormiga saad tutvuda SIIN.
NIPTIFY test on CE-IVD markeeringuga in vitro diagnostikameditsiiniseade, mis on valideeritud, kontrollitud ja registreeritud meditsiiniseadmete andmebaasis. NIPTIFY protseduurid viiakse läbi ISO 15189: 2012 akrediteeritud meditsiinilaboris sertifikaadiga M018. NIPTIFY test osaleb regulaarselt rahvusvahelises välises EMQN hindamisprogrammis ja on seni pälvinud hindamisel maksimaalsed punktid.
*DiGeorge mikrodeletsiooni (22q11) määramise tundlikkus on arvutatud piiratud hulga kontrollproovide põhjal, sest varasemalt ei ole 22q11 mikrodeletsiooni NIPTIFY paneelis olnud. Teaduskirjanduse põhjal on eeldatav NIPT testi tundlikkus 22q11 määramisel 70 – 100%.
Uuringu eeldused
Loote fraktsioon
Focus Plus tehnoloogia
Focus Plus tehnoloogia on arendatud spetsiaalselt NIPTIFY testi jaoks. Eesmärk oli viia madalast loote fraktsioonist tingitud kordusproovide vajadus minimaalseks ja võimaldada mikrodeletsioonide tuvastamine kõrge usaldusväärsusega. Focus Plus tehnoloogiaga rikastatakse loote päritolu rakuvaba DNA-d uuritavas proovis. Analüüsis on see keskmiselt 3,6 korda kõrgem võrreldes tavalise NIPT testiga. Kui tavalises NIPT testis on loote fraktsioon keskmiselt 5-10%, siis Focus Plus meetodiga keskmiselt 20-30%. Rohkem loote DNAd tähendab NIPTIFY testi jaoks veel kõrgemat tundlikkust peamiste trisoomiate ning eelkõige mikrodeletsioonide analüüsis. Focus Plus tehnoloogiaga on alla 4% loote fraktsiooni esinemise tõenäosus oluliselt madalam kui 1%.
NIPTIFY piirangud
NIPTIFY on DNA põhine uuring loote kromosoomhaiguste varaseks ja täpseks tuvastamiseks. NIPTIFY ei asenda ultraheliuuringut, mille eesmärgiks on tuvastada teisi loote arengulisi väärarenguid ja hinnata preeklampsia riski. Samuti ei asenda NIPTIFY seerumskriiningut, millega hinnatakse eelkõige preeklampsia riski.
Seetõttu jääb võimalus vale-negatiivseteks (haigusega lootel ei tuvastata sõeluuringuga kromosoomhaigust) või vale-positiivseteks tulemusteks (platsental on kromosoomhaigus, kuid loode on terve). Test võib anda valetulemusi erinevatel kliinilistel põhjustel nagu näiteks platsenta mosaiiksus, ema mosaiiksus, emal esinevad kromosoomianomaaliad, kasvajad või patsiendist mittesõltuvatel tehnilistel põhjustel. Madala kromosoomhaiguse riskiga testi tulemus ei välista teisi loote arengu kõrvalekaldeid, mida tuvastatakse ultraheli uuringuga. NIPTIFY ei anna infot loote arengurikete kohta nagu näiteks aju või südame arengurikked, selgroo arengurikked, loote kasvu häired jt. NIPTIFY abil ei ole võimalik määrata mosaiiksust, balanseeritud translokatsioone ja monogeenseid harvikhaigusi. NIPTIFY testi ei saa teha mitmikraseduse korral või kui patsiendil on käesoleva raseduse ajal tuvastatud pahaloomuline kasvaja.
NIPTIFY on sõeluuring, seetõttu on oluline kinnitada kõrge riski tulemus diagnostilise lootevee uuringuga.
NIPTIFY on Eestimaine
NIPTIFY Focus Plus on Eesti teadlaste ja arstide loodud kaasaegne meditsiiniteenus. NIPTIFY analüüs tehakse Tartus Täppismeditsiini laboris. Kodumaise NIPTIFY eelistamisega toetate ka Eesti teadust ning teie isiku- ja geeniandmed jäävad Eestisse. Testide tegemine Eestis arendab siinset meditsiinitehnoloogia valdkonda, hoiab väärtuslikke töökohti ning aitab kaasa kaasaegsete diagnostikavõimaluste arendamisele ja nende jõudmisele Eesti patsientideni.
NIPTIFY testide tegemine Eestis oli üheks põhjuseks, miks Haigekassa hakkas kõrgenenud riskiga rasedatele 2020. aastal hüvitama NIPT testi. Kuna NIPT on oluliselt täpsem kui OSCAR test, siis aitab see vähendada suunamisi invasiivsetele ja loote elukeskkonda tungivatele stressirohketele uuringutele. NIPTIFY hüvitatakse lisaks kõrgenenud riskile ka juhul kui eelnevalt on lapsel/lootel diagnoositud trisoomia või rasedal esineb lootevee uuringut mittevõimaldav terviseseisund. Haigekassa kompensatsiooniga saavad NIPTIFY analüüsi teha ainult 10-15% patsientidest. Ülejäänud pered saavad NIPTIFY testi tehes ise investeerida lapse tervisesse ja perekonna südamerahusse. Vereproovi NIPTIFY testiks saab anda kõikides naistekliinikutes üle Eesti.
Kui NIPTIFY on üksikrasedusele, siis mida teha kaksikraseduse korral?
Kui NIPTIFY on üksikrasedusele, siis mida teha kaksikraseduse korral?
Teadustöö NIPTIFY testi taga
NIPTIFY test loodi Tervisetehnoloogiate Arenduskeskuse, Tartu Ülikooli ja Belgia Leuveni Ülikooli teadlaste koostöös. NIPTIFY meeskond osaleb pidevalt arendustegevustes, et test oleks tulevikus konkurentsivõimeline ja pakuks rohkem võimalusi. Senine arendustöö ja kliiniline testimine on kokku võetud allolevates artiklites:
Priit Paluoja et al. (2022) BinDel: software tool for detecting clinically significant microdeletions in low-coverage WGS-based NIPT samples. MedRxiv preprint. Otseviide artiklile.
Priit Paluoja et al. (2021) Systematic evaluation of NIPT aneuploidy detection software tools with clinically validated NIPT samples. PLoS Comput Biol. 2021 Dec 20;17(12):e1009684. doi: 10.1371/journal.pcbi.1009684. Otseviide artikkel.
Olga Zhilina et al. (2019) Creating basis for introducing NIPT in the Estonian public health setting.Prenat Diagn. 2019 Dec;39(13):1262-1268. doi: 10.1002/pd.5578. Epub 2019 Nov 6. Otseviide artiklile.
Martin Sauk et al. (2018) NIPTmer: rapid k-mer-based software package for detection of fetal aneuploidies. Sci Rep. 8(1):5616. doi: 10.1038/s41598-018-23589-8. Otseviide artiklile.
Baran Bayindir et al. (2015) Noninvasive prenatal testing using a novel analysis pipeline to screen for all autosomal fetal aneuploidies improves pregnancy management. Eur J Hum Genet 23(10):1286-93. doi: 10.1038/ejhg.2014.282. Otseviide artiklile.